Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfraP26618 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms