Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hoxd12P23812 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hoxd12P23812 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hoxd12P23812 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd12P23812 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Hoxd12P23812 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Hoxd12P23812 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd12P23812 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd12P23812 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd12P23812 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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