Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PparaP23204 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PparaP23204 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms