Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms