Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfaP20033 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfaP20033 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfaP20033 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfaP20033 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfaP20033 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms