Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms