Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CtsdP18242 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsdP18242 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsdP18242 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsdP18242 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsdP18242 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms