Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpraP18052 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpraP18052 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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