Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms