Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms