Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhoP15409 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms