Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd44P15379 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms