Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrphP15331 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrphP15331 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrphP15331 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms