Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms