Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms