Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms