Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt8P11679 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms