Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamp1P11438 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms