Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Becn2P0DM65 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms