Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb8P09632 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms