Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms