Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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