Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnfP06804 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnfP06804 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnfP06804 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnfP06804 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TnfP06804 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnfP06804 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnfP06804 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnfP06804 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnfP06804 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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