Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2-Eb1P04230 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2-Eb1P04230 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-Eb1P04230 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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