Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01837 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01837 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01837 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01837 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01837 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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P01837 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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P01837 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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P01837 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01837 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01837 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01837 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01837 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01837 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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