Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01820 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01820 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01820 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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