Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms