Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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