Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BlmO88700 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BlmO88700 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BlmO88700 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms