Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AvilO88398 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AvilO88398 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AvilO88398 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AvilO88398 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AvilO88398 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AvilO88398 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AvilO88398 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms