Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stx7O70439 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms