Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tspan6O70401 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms