Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtssO70370 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms