Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lnx1O70263 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms