Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Top3aO70157 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3aO70157 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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