Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja1O55176 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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