Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms