Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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