Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms