Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms