Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffaO54786 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffaO54786 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffaO54786 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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