Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb10O35955 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms