Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nek2O35942 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek2O35942 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek2O35942 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek2O35942 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek2O35942 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek2O35942 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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