Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Sp100O35892 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sp100O35892 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sp100O35892 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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