Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf18O35714 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms