Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc27a2O35488 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a2O35488 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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