Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrt1O35449 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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