Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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H2-ObO35424 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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H2-ObO35424 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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H2-ObO35424 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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H2-ObO35424 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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H2-ObO35424 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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