Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms