Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smad6O35182 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smad6O35182 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad6O35182 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms